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Antragsnummer:  VBS0078 
Version 1  12/2020

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Automatisierte zweistufige Reinigung mit Kationenaustauschchromatographie und Entsalzung

Ulrike Krop, Kate Monks; applications@knauer.net KNAUER Wissenschaftliche Geräte GmbH, Hegauer Weg 38, 14163 Berlin

Automated two step purification with cation exchange chromatography and desalting

Zusammenfassung

In vielen Fällen erfordert die Proteinreinigung zwei oder sogar mehr Schritte, um eine ausreichende Reinheit zu erreichen. Der Übergang von einem Schritt zum anderen kann sehr zeitaufwendig sein und erfordert manuelle Interaktion. Diese Einschränkungen verdeutlichen die Notwendigkeit von FPLC-Systemen, die eine automatisierte Zweischritt-Reinigung ermöglichen. Diese Anwendung hebt die Möglichkeit hervor, zwei aufeinanderfolgende Chromatographieprotokolle zu kombinieren. Dies wurde mit dem KNAUER Lab Standard Multi Method FPLC-System erreicht, das für die automatische Zweischritt-Reinigung angepasst wurde. Eine beispielhafte Trennung von Modellproteinen durch Kationenaustauschchromatographie, gefolgt von Entsalzung, wird gezeigt. Dieser Ansatz kann leicht an verschiedene Protokolle zur Proteinreinigung angepasst werden.

Einführung

Für viele Proteinreinigungen werden mehrere chromatographische Schritte verwendet, um reines Protein zu erreichen. Je nach gewünschtem Ertrag und Reinheit des Zielproteins werden verschiedene Methoden kombiniert. In vielen Fällen werden zwei Schritte zur Proteinreinigung verwendet. Für die Zweischritt-Reinigung werden zwei unabhängige Methoden, jeweils mit ihrer spezifischen Säule, eingesetzt, um die Reinigung des Zielmoleküls ohne manuelle Eingriffe zu realisieren. Das allgemeine Prinzip besteht darin, dass die Proteinprobe auf die erste Säule aufgetragen wird. Während der Elution des Proteins wird der Proteinpeak erkannt, was seine Sammlung in einer Speicher-Schleife oder einem Speicherbehälter auslöst. Anschließend wird das Zielprotein automatisch auf die zweite Säule aufgetragen, um die Qualität und/oder Reinheit weiter zu verbessern. Die schnelle und automatisierte Verbindung von zwei chromatographischen Reinigungsstufen zu einer Methode eliminiert die manuelle Probenhandhabung und minimiert die Zeit, die zwischen den Schritten benötigt wird. Diese Automatisierungsstrategie kann leicht an verschiedene Reinigungsaufgaben angepasst werden, um Ihre Effizienz zu steigern und den Arbeitsablauf zu optimieren. In diesem Anwendungsnotiz wurde ein KNAUER Lab Standard Multi Method FPLC-System für alle biochemischen Chromatographiemethoden für die Zweischritt-Reinigung angepasst. Zwei Modellproteine, Cytochrom C und Ribonuklease A, wurden durch Kationenaustauschchromatographie getrennt. Cytochrom C wurde automatisch in einer Proben-Schleife gespeichert und auf eine zweite Säule für den Pufferaustausch mit einer Entsalzungssäule aufgetragen.

Ergebnisse

Der erste Schritt der Trennung war die Kationenaustauschchromatographie. Die Proteine wurden aufgrund ihrer positiven Ladung im Puffer bei pH 6,8 ausgewählt. Ribonuklease A hat einen isoelektrischen Punkt von 9,6, während für Cytochrom C ein Bereich von 10,37 bis 10,80 für den isoelektrischen Punkt angegeben ist. Unter den Anfangsbedingungen bindeten beide Proteine an die Kationenaustauschsäule. Während der Gradientenelution eluierte zuerst Ribonuklease A und später Cytochrom C aus der Säule (Abb. 1). Ein Schwellenwertsignal (Abb. 1, rote Linie) wurde verwendet, um Cytochrom C zu detektieren, was die Zwischenlagerung in der Proben-Schleife auslöste. Das Cytochrom C wurde anschließend erneut auf die Entsalzungssäule injiziert, um den Puffer auf die endgültigen Pufferbedingungen auszutauschen (Abb. 2). Das eluierte Protein wurde fraktioniert.

Chromatogram of the cation exchange method. Blue line: UV 280 nm (blue), conductivity (black), threshold used for peak recognition (red). 1 - Ribonuclease A, 2 - Cytochrome C.

Abb. 1 Chromatogramm der Kationenaustauschmethode. Blaue Linie: UV 280 nm (blau), Leitfähigkeit (schwarz), Schwellenwert zur Peak-Erkennung (rot). 1 - Ribonuklease A, 2 - Cytochrom C.

Chromatogram of the desalting method. UV 280 nm (blue), conductivity (black). 1 - Cytochrome C, 2 - Salt peak.

Chromatogramm der Entsalzungsmethode. UV 280 nm (blau), Leitfähigkeit (schwarz). 1 - Cytochrom C, 2 - Salzpeak.

Flow scheme of the lab standard KNAUER Multi Method FPLC system for all bio chromatography methods adapted for two step purification with the basic set up.

Fließschema des Laborstandards KNAUER Multi Method FPLC-Systems für alle biochemischen Chromatographiemethoden, die für die zweistufige Reinigung mit der Grundausstattung angepasst sind.

Probenvorbereitungen

Lyophilisiertes Cytochrom C aus dem Rinderherz (CAS# 9007-43-6) und lyophilisierte Ribonuklease A aus der Rinderbauchspeicheldrüse (9001-99-4) wurden verwendet. Beide Proteine wurden in Puffer A auf eine Endkonzentration von 0,5 mg/ml gelöst. Insgesamt wurden 2 ml Probe (1 mg jedes Proteins) für jede Reinigung injiziert. Die Probe wurde vor der Verwendung gefiltert (0,45 µm). Ein Labornorm KNAUER Multi Method FPLC-System für alle biochemischen Chromatographiemethoden wurde für die zweistufige Reinigung angepasst. Ein Säulenauswahlventil und ein Auslassventil wurden dem System hinzugefügt. Dies zeigt die grundlegende Einrichtung für die zweistufige Reinigung. Die Reinjektionsposition des Auslassventils war mit dem Probenpumpeneingang des Injektionsventils verbunden. Die Probe wird über die Proben-Schleife des Injektionsventils injiziert. Der erste Peak wird ebenfalls in der Proben-Schleife des Injektionsventils gesammelt und auf die zweite Säule reinjiziert.

Fazit

Das Modellprotein Cytochrom C wurde erfolgreich aus Ribonuklease A durch eine automatisierte Kombination aus Kationenaustauschchromatographie und einer Entsalzungsmethode auf dem Labornorm KNAUER Multi Method FPLC-System im Grundaufbau für die zweistufige Reinigung isoliert. Es war keine manuelle Interaktion erforderlich. Dieses Methodensetup könnte leicht an andere Reinigungsprotokolle zur Trennung und Reinigung von Biomolekülen angepasst werden.

Ähnliche KNAUER-Anwendungen

VBS0070 – Ionenaustauschchromatographie mit dem AZURA® Bio-Reinigungssystem

VBS0072 – Trennung von Proteinen mit Kationenaustauschchromatographie auf Sepapure SP und CM

VBS0075 – Gruppentrennung mit Sepapure Entsalzung auf dem AZURA® Bio-Reinigungssystem

Materialien und Methoden

Tab. 1 Methode

Kolonnentemperatur

RT

Probe Schleifenvolumen

2 ml

UV-Detektion

280 nm

Datenrate

2 Hz

Puffer A

25 mM Natriumphosphatpuffer pH 6,8

Puffer B

25 mM Natriumphosphatpuffer pH 6,8 + 1M NaCl

Puffer C

PBS 0,01 M phosphategepufferte Salzlösung (NaCl 0,138 M; KCl - 0,0027 M); pH 7,4

Tab. 2 Kationenaustauschmethode

Spalte

Sepapure CM FF6 1 ml

Durchflussrate

1 ml/min

Gradient​

5 ml Schritt 100% A10 ml gradient 100% A to 60% A / 40% B

Spitzenanerkennung

10-15 ml
Schwelle: UV 280 nm 100 mAU

Tab. 3 Entsalzung

Spalte

Sepapure Entsalzung 5 ml

Durchflussrate

2.5 ml/min

Gradient​

1,5 CV isokratisches Puffer C

Waschen und Äquilibrierung der Kationenaustauschmethode

Spalte

Sepapure CM FF6 1 ml

Durchflussrate

1 ml/min

Gradient​

5 ml step 100% B

10 ml step 100% A

Tab. 5 Systemkonfiguration

Instrument

Beschreibung

Artikel Nr.

Pumpe

AZURA P6.1L, LPG metallfrei, FPLC-Pumpe mit niedrigem Druckgradienten und 10 ml Pumpenkopf, Keramik

APH64EB

Dockingstation

UV-Detektor

Ventilantrieb

Ventilantrieb

AZURA Assistent ASM 2.2L

Linkes Modul: UV-Detektor UVD 2.1S

Mittleres Modul: Ventilantrieb VU 4.1

Rechtes Modul: Ventilantrieb VU 4.1

AY0001

EDA03XA

EWA04

EWA04

UV-Flusszelle

Semi-präparative biokompatible 3 mm UV-Flusszelle

A4045

Injektionsventil

AZURA V 4.1 Ventil Multi-Injektionsventil, biokompatibel, 1/16"

AVN94CE

Auslassventil

AZURA V 4.1 Ventil Biokompatibles Mehrpositionsventil, 8 Anschlüsse

AVS34CE

Kolonnenauswahlventil

VICI Säulenauswahlventil Biokompatibles Säulenauswahlventil, für 5 Säulen, 1 Bypass, Rückfluss, 12 Anschlüsse, 1/16", 50 bar

AVZ52CE

Ventilantrieb

AZURA Ventilvereiniger VU 4.1 Intelligenter Ventilantrieb mit RFID-Technologie für Ventile V 4.1

AWA01XA

Leitfähigkeitsmonitor

AZURA CM 2.1S mit Durchflusszelle bis zu 100 ml/min Leitfähigkeitsmonitor mit Durchflusszelle für bis zu 100 ml/min und optionaler pH-Messung

ADG30GD

Fraktionensammler

Fraktionensammler Foxy R1

A59100

Software

PurityChrom® Basic

A2650

Spalte 1

Sepapure CM FF6 1 ml, schwacher Kationenaustausch, vorverpackt 1 ml, 100 µm, 3 bar

010X15QSPZ

Spalte 2

Sepapure Entsalzung 5 ml, vorverpackt 5 ml, 20–50 µm, 3 bar

020X460SPZ

KNAUER Two step purification System Configuration

Application details

Methode

Zwei-Schritt-Reinigung

Modus

IEC

Substanzen

Cytochrom C, Ribonuklease A

CAS-Nummer

Cytochrom C: CAS 9007-43-6; Ribonuklease A: CAS 9001-99-4

Version

Anwendungsnummer: VBS0078 | Version 1 12/2020 | ©KNAUER Wissenschaftliche Geräte GmbH